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논문 기본 정보
- 자료유형
- 학술저널
- 저자정보
- 발행연도
- 2023.12
- 수록면
- 1,025 - 1,035 (11page)
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본 연구에서는 한국산과 중국산 새꼬막(Scapharca subcrenata) 사이의 원산지 판별을 위하여 quantitative real-time PCR (qPCR) 분석을 기반으로 하는 Single-nucleotide polymorphism (SNP) 마커의 primer set를 개발 및 검증하였다. 총 180개의 새꼬막 sample을 genotyping by sequencing으로 분석하여 원산지 판별에 유용할 것이라 판단되는 7개의 후보 MS 마커와 15개의 후보 SNP 마커를 선정하였다. 후보 SNP 마커는 PCR과 sanger sequencing, SYBR green-based qPCR을 통해 원산지별 분리 여부를 확인하였다. 이 중 Insertion 1, SNP 21 마커가 qPCR 증폭 양상에서 집단이 확연히 분리되었으며 예상과 실제 증폭 형태가 일치하였다. 추가적으로 새꼬막을 무작위로 섞어서 진행한 blind test에서 Insertion 1은 새꼬막 100개에 대하여 74%의 정확도, 52%의 민감도, 96%의 특이도를 보였고, SNP 21은 새꼬막 137개에 대하여 86%의 정확도, 79%의 민감도, 93%의 특이도를 보였다. 따라서 개발된 두 개의 SNP 마커는 독립적 또는 복합적으로 사용하면 새꼬막 원산지 판별의 진위 여부를 검증하는 데 유용할 것으로 기대된다.
목차
서론
재료 및 방법
결과
고찰
References
초록
참고문헌 (18)
참고문헌 신청
Bang, K. H., Yu, H. S., Koo, D. H., Cho, J. H., Park, H. W., Seong, N. S., Park, S. I. and Kim, H. S. 2002. Selection of RAPD marker to discriminate the bolting-resistant varieties and commercial dried medicinal materials of Angelica species. Kor. J. Medi
Bradbury, P. J., Zhang, Z., Kroon, D. E., Casstevens, T. M., Ramdoss, Y. and Buckler, E. S. 2007. TASSEL: software for association mapping of complex traits in diverse samples. Bioinformatics 23, 2633-2635.
Guo, C., Wang, Y., Hu, W., Mei, J. and Guo, W. 2020. Development of SNP markers and validation 24 SNPs in darkbarbel catfish (Pelteobagrus vachelli). Conserv Genet Resour. 12, 413-416.
Gut, I. G. 2001. Automation in genotyping of single nucleotide polymorphisms. Hum Mutat. 17, 475-492.
Gut, I. G. 2004. An Overview of Genotyping and Single Nucleotide Polymorphisms (SNP). J. Wiley.
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